Microorganism identification

La Unidad de Técnicas Bioanalíticas (Unidad BAT) es una unidad de servicios comunes del Instituto de Investigación en Ciencias de la Alimentación (CIAL, CSIC-UAM), que cuenta con instrumentación de alto rendimiento e instalaciones para realizar una amplia gama de medidas analíticas. La Unidad está compuesta de dos laboratorios de nivel de contención biológica P2 (Microbiología y Cultivos Celulares), con áreas auxiliares de Preparación de Medios y Descontaminación, un Laboratorio de Técnicas Bioanalíticas, cuatro áreas de Equipamiento Auxiliar, así como equipamiento para preparación de muestras en la Planta Piloto. La función de la Unidad BAT es ofrecer soporte científico-técnico al personal investigador, a través del mantenimiento de laboratorios y equipamiento, ocupándose de la seguridad y prevención de los mismos, empleando los métodos apropiados para los análisis de las muestras, así como diseñando un flujo de trabajo adaptado para cada objetivo/proyecto.

La Colección del MIcrobioma de Plantas surge con el objetivo de consolidar las colecciones de endófitos del IRNASA-CSIC. Durante las dos últimas décadas varios grupos de investigación del IRNASA-CSIC se ha dedicado al estudio de la diversidad biológica y función de microorganismos no patógenos asociados a plantas, principalmente hongos y bacterias endófitas, dando lugar a una extensa colección de microorganismos. Actualmente estamos trabajando en tareas de conservación, clasificación e identificación de los recursos existentes. Actualmente ofrece los siguientes servicios a usuarios internos y externos: - Análisis de calidad de DNA, RNA mediante un bioanalizador de fragmentos basado en electroforesis automático de alta resolución - Identificación de cultivos de hongos filamentosos basada en secuenciación de rDNA - Caracterización de cepas: capacidad de solubilización de fosfato

Se ofertan los siguientes análisis: Caracterización alimentos y microorganismos: Métodos morfológicos: Microscopía óptica convencional, de epifluorescencia y confocal. Métodos fenotípicos: Métodos dependientes de cultivo. Aislamiento y recuento en placa. Crecimiento en medios diferenciales Métodos moleculares: Identificación molecular, PCR, Cuantificación por PCR, análisis transriptómico y genómico. Aislamiento, identificación y cuantificación de bacteriófagos.

El servicio satisface la necesidad de obtener y analizar micoorganismos y sus biomoléculas (incluyendo enzimas) bajo una gran variedad de condiciones y sobretodo para aquellos microorganismos difíciles de cultivar. Se ofrece personalizar las necesidades de empresas privadas, centros públicos o investigadores incluyendo todo tipo de escenarios desde cultivos monoespecíficos hasta sistemas altamente complejos (como ecosistemas naturales, suelos, etc.), desde <0ºC a >100ºC, en aerobiosis o anaerobiosis y destinado a cualquier disciplina tanto investigación como desarrollo industrial. Se ofrecen: - Sistemas de bioreactores de alta flexibilidad incluyendo crecimiento contínuo (quimiostato) y sistema de crecimiento a tasas mínimas o de mantenimiento (retentostato). - Análisis y detección de microorganismos y/o biomoléculas utilizando técnicas variadas de biología molecular, genómica, bioinformática, expresión génica, bioquímica, etc. - Cultivos de microorganismos. - Asesoría.