Analisis por microscopía confocal

La microscopía óptica es una de las herramientas de investigación fundamentales en el IBFG. Hoy en día, con el desarrollo y las aplicaciones de las proteínas fluorescentes, es posible el diseño de experimentos complejos que permiten estudiar la dinámica de los procesos celulares en células vivas. Estos experimentos pueden ser realizados adquiriendo imágenes de las muestras que proporcionan información multidimensional en x, y, z, longitud de onda y tiempo. El servicio de microscopía tiene una dotación de equipos que permiten trabajar con una amplia gama de técnicas de microscopía óptica, desde la adquisición de imágenes de campo claro y fluorescencia convencional, hasta las microscopías confocales espectral y “spinning disk”. El servicio también tiene el equipamiento informático con los programas necesarios para el procesamiento de las imágenes adquiridas en los experimentos.

El Servicio de Microscopía, Confocal e Imagen es un servicio científico-técnico del IRNASA (en adelante SMCI) que se constituye con los objetivos siguientes: - Gestión de los equipos y recursos de Microscopía óptica y confocal en el IRNASA – CSIC, ofreciendo también su servicio a usuarios externos. El SMCI ofrece servicios para la obtención de imágenes y tratamiento para su posterior uso en la investigación, tanto al personal del IRNASA como a otros OPIs, Universidades o empresas privadas.

Los grupos de Investigación del IPBLN son asistidos por esta unidad de apoyo que además presta sus servicios a otras Instituciones, Hospitales y Empresas en Granada. El servicio se subdivide en dos sub-unidades: Unidad de Microscopía (UM) y la Unidad de Análisis de Imágenes Digitales (UAID). Equipamiento del Servicio (mas detalle en pagina web) Zeiss Axio Imager A1: Microscopio epifluorescencia vertical/Leica DM2000: Microscopio de Luz Transmitida. Digitalizado de imagen/Olympus ix81: Microscopio epifluorescencia invertido. Exp. in vivo/ Leica sp5: Microscopio confocal. Lineas laser: Diodo UV, Argón ( 458,476, 488,496 y 514nm), HeNe 561,HeNe 633/ Leica DMi8 célula viva: platina motorizada, alta sensibilidad, precisión y velocidad. Software avanzado. Iluminacion LED/. Leica sp8 STED: laser blanco. Lightning y STED. El Servicio de Microscopia ofrece asesoria y formación en Análisis de imagen Digital. Dispone de distintos softwares para tal fin: Imaris, Huygens y otros de uso libre.

El laboratorio de Corrosión del CENIM/CSIC desarrolla su actividad investigadora en dos vertientes diferentes íntimamente inter-relacionadas. En la primera de ellas, se realizan estudios básicos encaminados a entender los mecanismos que conducen al deterioro de los metales en ambientes agresivos, así como el desarrollo de nuevos materiales y métodos de protección frente a la corrosión. Se trata por tanto, de una labor eminentemente científica. No obstante, toda la experiencia del grupo y el equipamiento también se pone a disposición de las empresas para aportar soluciones a los problemas de corrosión que aparecen en los materiales durante su vida en servicio.

El Servicio de Microscopía Confocal y Citometría del IBVF presta sus servicios tanto a los miembros del propio Instituto como a interesados externos, ya sean pertenecientes a organismos públicos como a entidades privadas. El Servicio incluye el encendido y puesta en marcha del equipo y la asistencia técnica por el personal responsable del servicio. El Servicio cuenta con un Citómetro Separador BD Influx, un Microscopio de Fluorescencia Leica DM6000 y un Microscopio de Fluorescencia Láser Confocal Leica SP2. Nuestros usuarios son principalmente del campo de la biología y biomedicina, aunque de forma ocasional, se han realizado estudios de materiales en microscopía confocal. Las muestras que usualmente analizamos son cultivos in vivo de cianobacterias o microalgas, tejidos vegetales (hojas, raíces y tallos) o plántulas enteras, cortes de tejidos vegetales y animales y superficie de materiales.

La misión del Servicio es prestar soporte y asesoramiento a los organismos públicos y privados que así lo soliciten. El servicio consta de tres divisiones: Caracterización de Superficies y recubrimientos: cuenta con un perfilómetro 3D óptico, un nano-indentador y un microscopio de sonda local, que, permiten realizar topografías de superficies, desde los milímetros a los nanómetros, así como estudios de propiedades elásticas y otras propiedades físicas en el rango de la nanoescala. Análisis Elemental: permite la determinación de la composición porcentual de carbono, hidrógeno, nitrógeno y azufre, de forma simultánea, de una muestra o compuesto en estado sólido o líquido. Análisis Térmico: estudia los cambios producidos en alguna propiedad del material en función de la temperatura. Cuenta con equipos de calorimetría diferencial de barrido (determinación de absorciones y emisiones de calor vs temperatura), y termogravimetría (determinación la variación de masa vs temperatura

El Servicio de Microscopía Óptica y Confocal del IIBm proporciona a sus usuarios una variedad de técnicas en microscopia acorde con las investigaciones que se realizan en el centro. Nuestros objetivos son dar soporte técnico tanto en la adquisición como en el análisis de las imágenes, formar a los usuarios en el uso de los equipos, participar en el desarrollo de nuevas técnicas y en la optimización de las ya establecidas para proporcionar los mejores resultados. Trabajamos bajo la norma de gestion de la calidad (UNE-EN ISO 9001:2000) y estamos certificados con el nº de registro ER-1326/2009. Nuestros equipos están disponibles para los usuarios del IIBm así como para investigadores de otras instituciones públicas o privadas. Formamos parte de la red de laboratorios de la Comunidad de Madrid (Registro Nº 338).

El trabajo realizado por el servicio de Microscopía del IBGM, puede resumirse en dos aspectos.Por una parte, el destinado al uso del Microscopio Confocal Leica TCS SP5 X, y por otra, aquel en el que se realizan las labores de mantenimiento y gestión de los equipos de microscopía que dispone el Instituto. Las labores realizadas con el Microscopio Confocal Leica SP5, van desde la preparación de los settings adecuados para cada muestra, la adquisición de imágenes confocales de las muestras de los usuarios del Servicio y ayuda sobre los programas de tratamiento de imágenes. El trabajo derivado del mantenimiento y gestión de los equipos, consiste en dar una guía de uso de los mismos a los nuevos usuarios del Servicio, prestar ayuda cuando éstos encuentren algún tipo de problema, y chequear el buen funcionamiento de los equipos (microscopios de Fluorescencia Nikon).

El Servicio de Microscopía Confocal y Electrónica de Transmisión (CTEM) tiene como finalidad satisfacer la creciente demanda de los investigadores del Centro en este ámbito. El Servicio pretende organizar, gestionar, optimizar y fomentar el uso de los grandes equipos de microscopía disponibles en el Instituto. También facilita la preparación estándar de las muestras antes de su observación. El Servicio está disponible tanto para los investigadores de las sublíneas de investigación de la EEZ (servicio interno) como para otras instituciones académicas y comerciales (servicio externo).

El Servicio de Microscopía del IBMCP cubre un amplio rango de aplicaciones en Microscopía óptica avanzada. Se cuenta con equipos para la preparación de las muestras, la observación de las mismas y recursos para el posterior análisis de imagen están disponibles para los investigadores del CSIC así como para miembros de otros centros de investigación. La unidad ofrece soporte técnico durante todo el proceso, desde la preparación de la muestra hasta la adquisición de la imagen y su análisis posterior.

La unidad de microscopía e histología es un servicio de investigación que ofrece la posibilidad de preparar muestras y observarlas por microscopía óptica y confocal. La unidad provee acceso al siguiente equipamiento: Estación automática de deshidratación e inclusión de muestras en parafina, dos criostatos, un vibratomo, un micrótomo, cuatro microscopios de luz transmitida y epifluorescencia, dos de ellos invertidos y todos con microfotografía digital, un microscopio estereológico, un microscopio confocal, y un microscopio spinning disk. También se dispone de una workstation de última generación con diferentes softwares de análisis de imágenes: ImageJ/Fiji, Cell Profiler, LAS X y ZEN Blue. La unidad de histología y microscopia proporciona asistencia técnica desde el diseño de experimentos hasta el análisis de los resultados obtenidos. Su función es proveer un servicio de calidad en técnicas histológicas y microscopia óptica.

La presencia de marcadores fluorescentes en las muestras permite la utilización de una amplia variedad de aproximaciones experimentales en células vivas y fijadas. El servicio proporciona el equipamiento necesario para la realización de estudios de microscopía de epifluorescencia, confocal y superresolución mediante FLIM, FCS, DLS, STED, TIRF y SMLM, así como las herramientas informáticas para el procesamiento y análisis de las imágenes digitales generadas. El personal del servicio ofrece asistencia y entrenamiento en la utilización de los equipos, diseños experimentales, aplicaciones y metodologías de procesamiento/análisis de imagen. El servicio mantiene y proporciona un stock de reactivos, anticuerpos secundarios y soportes de cultivo ampliamente utilizados en las aplicaciones de microscopía de fluorescencia. El Servicio está certificado por la norma ISO 9001:2015, y forma parte de la Red de Laboratorios de la Comunidad de Madrid y la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada.

Determinación de número cromosómico, detección de anomalías cromosómicas (pérdida o ganancia de segmentos cromosómicos o cromosomas completos, traslocaciones cromosómicas, deleciones, etc., ) Identificación de introgresiones genéticas mediante hibridación in situ y marcadores moleculares

Servicio de análisis de materiales arqueológicos que incluye: - Como servicios internos y externos: Captura y creación de modelos 3D, Análisis funcional de instrumentos líticos y en materias duras animales, Caracterización de materias primas líticas y determinación de su área fuente, y análisis de fitolitos. El servicio dispone, como equipamiento, de cámaras fotográficas réflex, escáner 3D, equipos de microscopía de altos y bajos aumentos, cubeta de ultrasonidos, campana extractora y equipo de toma y preparado de muestras.

Servicio de Microscopía óptica y de fluorescencia dotado para adquisición de imagen con dos microscopios confocales Leica (modelos SP5 y SP8 STED 3X); Un microscopio Leica THUNDER con aclaramiento computacional instantaneo. Cámaras para fluorescencia (K5) y para histología (Flexacam). Un microscopio multidimensional de campo ancho Leica AF6000LX con CCD y software de adquisición y análisis LASX de Leica. Control de tª y CO2. Platina motorizada. Un microscopio DMi8 Leica con cámara sCMOS Orca Flash 4.0 LT y divisor W-View Gemini para la adquisición simultánea de dos canales: GFP y mCherry. Control de tª. Software de adquisición y análisis Metamorph Un Un microscopio Zeiss axioplan de epifluorescencia y contraste de fase con cámara Leica DFC 350FX Un Estereomicroscopio Leica MZ16FA con cámara en color Leica DCF490. Sistema de microfluídica CELLASIC ONIx2 Estacion de trabajo para análisis y procesamiento de imágenes. Huygens: deconvolución y colocalización.

El Servicio de Análisis por Técnicas No destructivas del MNCN-CSIC de Madrid presta su asistencia a aquellos departamentos y/o grupos de Investigación del MNCN así como a otros organismos o entidades públicas o privadas, que así lo soliciten. El Servicio cuenta con un Microscopio Electrónico de Barrido Ambiental (QUANTA 200, con opción de Alto y Bajo Vacío y modo Ambiental) con EDS y WDS y Peltier de enfriamiento y calentamiento; un Microscopio Electrónico de Barrido de Bajo y Alto Vacío (Inspect) con EDS y Catodoluminiscencia espectral y de imagen en UV-IR; Microscopio Confocal con espectroscopia RAMAN con pletina de enfriamiento, un Microscopio Confocal Espectral de fluorescencia, Tomografía Computerizada de Rayos X (CT-scan), un Microscopio 3D de alta resolución y equipos de apoyo como el de de análisis térmico ATD/ TGA (Perkin Elmer) y un analizador de la distribución del tamaño de partícula por difracción láser (Beckman- Coulter), Secado por punto Crítico y metelizadores de Au

El Servicio de Microscopía Óptica Avanzada (SMOA) es un servicio central de apoyo a la investigación del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. El SMOA dispone de sistemas avanzados de microscopía óptica, así como equipamiento informático especializado en la visualización y el análisis de imágenes. El equipo técnico del SMOA gestiona y mantiene los equipos de microscopía e informáticos, brinda soporte científico-técnico y asesora y forma (mediante seminarios y sesiones teórico-prácticas) a los investigadores en las técnicas de microscopía óptica. Asimismo, el personal del SMOA almacena y distribuye reactivos relacionados con estas técnicas y trabaja para mantener el servicio actualizado, incorporando y configurando nuevos sistemas. El SMOA pertenece a la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada (REMOA), a la Red de Laboratorios e Infraestructuras (RedLab) y a la Plataforma de Microscopía para Biociencias y mantiene una acreditación de calidad y control ISO 9001:2015 (AENOR).

El Basque Resource for Advanced Light Microscopy (BRALM) del Instituto Biofisika es un servicio que ofrece equipamiento y recursos punteros de microscopía óptica avanzada y análisis digital de imagen. BRALM se enfoca en el análisis cuantitativo de imagen de eventos celulares a través de la implementación de sofisticados modos de imagen y análisis de datos. BRALM forma parte del nodo "Advanced Light Microscopy Node Bilbao (ALM@BIO)" de la red EuroBioImaging ERIC. Más información: https://bralm.biofisika.org