Conventional microscopy analysis

El Servicio de Microscopía Óptica y Confocal del IIBm proporciona a sus usuarios una variedad de técnicas en microscopia acorde con las investigaciones que se realizan en el centro. Nuestros objetivos son dar soporte técnico tanto en la adquisición como en el análisis de las imágenes, formar a los usuarios en el uso de los equipos, participar en el desarrollo de nuevas técnicas y en la optimización de las ya establecidas para proporcionar los mejores resultados. Trabajamos bajo la norma de gestion de la calidad (UNE-EN ISO 9001:2000) y estamos certificados con el nº de registro ER-1326/2009. Nuestros equipos están disponibles para los usuarios del IIBm así como para investigadores de otras instituciones públicas o privadas. Formamos parte de la red de laboratorios de la Comunidad de Madrid (Registro Nº 338).

Los grupos de Investigación del IPBLN son asistidos por esta unidad de apoyo que además presta sus servicios a otras Instituciones, Hospitales y Empresas en Granada. El servicio se subdivide en dos sub-unidades: Unidad de Microscopía (UM) y la Unidad de Análisis de Imágenes Digitales (UAID). Equipamiento del Servicio (mas detalle en pagina web) Zeiss Axio Imager A1: Microscopio epifluorescencia vertical/Leica DM2000: Microscopio de Luz Transmitida. Digitalizado de imagen/Olympus ix81: Microscopio epifluorescencia invertido. Exp. in vivo/ Leica sp5: Microscopio confocal. Lineas laser: Diodo UV, Argón ( 458,476, 488,496 y 514nm), HeNe 561,HeNe 633/ Leica DMi8 célula viva: platina motorizada, alta sensibilidad, precisión y velocidad. Software avanzado. Iluminacion LED/. Leica sp8 STED: laser blanco. Lightning y STED. El Servicio de Microscopia ofrece asesoria y formación en Análisis de imagen Digital. Dispone de distintos softwares para tal fin: Imaris, Huygens y otros de uso libre.

El Servicio de Microscopía, Confocal e Imagen es un servicio científico-técnico del IRNASA (en adelante SMCI) que se constituye con los objetivos siguientes: - Gestión de los equipos y recursos de Microscopía óptica y confocal en el IRNASA – CSIC, ofreciendo también su servicio a usuarios externos. El SMCI ofrece servicios para la obtención de imágenes y tratamiento para su posterior uso en la investigación, tanto al personal del IRNASA como a otros OPIs, Universidades o empresas privadas.

El Servicio de Microscopía Óptica Avanzada (SMOA) es un servicio central de apoyo a la investigación del Centro de Biología Molecular Severo Ochoa. El SMOA dispone de sistemas avanzados de microscopía óptica, así como equipamiento informático especializado en la visualización y el análisis de imágenes. El equipo técnico del SMOA gestiona y mantiene los equipos de microscopía e informáticos, brinda soporte científico-técnico y asesora y forma (mediante seminarios y sesiones teórico-prácticas) a los investigadores en las técnicas de microscopía óptica. Asimismo, el personal del SMOA almacena y distribuye reactivos relacionados con estas técnicas y trabaja para mantener el servicio actualizado, incorporando y configurando nuevos sistemas. El SMOA pertenece a la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada (REMOA), a la Red de Laboratorios e Infraestructuras (RedLab) y a la Plataforma de Microscopía para Biociencias y mantiene una acreditación de calidad y control ISO 9001:2015 (AENOR).

El Laboratorio de Micromorfología de la EEAD puede impregnar con resina plástica muestras de suelos, sedimentos y otros materiales, tanto pétreos como no consolidados. Los bloques impregnados se cortan con sierra diamantada para tener tabletas con una cara plana. También se pueden fabricar cortes delgados de 25 µm de espesor para su estudio con luz polarizada. El desbaste y rectificación se hacen con aceite ligero consiguiendo así respetar los minerales solubles en agua. Los tamaños estándar de nuestras tabletas y cortes delgados montados sobre portaobjetos son 135 × 58 mm o bien 58 mm × 45 mm. Eestos tamaños permiten detectar rasgos mesomorfológicos como estructura edáfica o sedimentaria, rasgos de fauna, distribución de elementos detríticos o de industrias líticas, restos vegetales o animales, etc. Se pueden cubrir los cortes delgados con cubreobjetos del tamaño adecuado. Preparaciones así obtenidas se han conservado en perfectas condiciones para su estudio durante más de 30 años.

La actividad fundamental del Laboratorio es la preparación de muestras metálicas que permita el estudio de defectos, características microestructurales y alteraciones estructurales de materiales utilizando par ello métodos ópticos de observación para relacionarlas con sus propiedades físicas y mecánicas. La microestructura de los metales y sus aleaciones depende de su historia metalúrgica, esto es, de su composición química, proceso de solidificación, tratamientos mecánicos y térmicos, y si es aplicable a los procesos de soldadura y tratamientos superficiales. Por esta razón la metalografía es fundamental en el estudio de los metales y se emplea tanto en la investigación y desarrollo, control de calidad y análisis de fallos. Para ello el Laboratorio dipone de: - cortadoras abrasivas y de precisión, prensas de montaje y pulidoras metalográficas - microscopios ópticos y estereoscópicos -microdurómetros

Servicios analíticos para el diagnóstico de enfermedades de etiología parasitaria e infecciosa que afecten principalmente a rumiantes.

El Servicio de Microscopía y Citometría en IMEDEA brinda apoyo científico al uso de microscopios y citometría de flujo para investigadores internos y externos. Equipado con microscopios ópticos, sistemas confocales y otros accesorios, analiza microorganismos mediante citometría de flujo y FlowCam. Ofrece desarrollo de protocolos, entrenamiento de usuarios, mantenimiento de equipos y una sala limpia para preparación de chips microfluídicos mediante fotolitografía blanda. Ubicado en Esporles, cuenta con varios microscopios y equipos de citometría como Leica TCS SP5 CONFOCAL, Zeiss Axio imager A2, citómetro BD FACSAria y FlowCAM.

Soporte y formación en observación y análisis de imagen de estructuras calcificadas en organismos marinos con patrones de crecimiento diario o similar que requieren análisis microestructural. Laboratorio especializado y de referencia internacional para el análisis de mandíbulas (picos) de cefalópodos, tanto en adultos como en estadios tempranos. Puede prestar asesoramiento y formación en la preparación de picos y otras estructuras calcificadas de cefalópodos, disponiendo del material de inclusión y pulido con pasta de diamante para preparar este tipo de estructuras. Servicio dotado de equipamiento con amplia gama de técnicas de microscopía óptica: iluminación diascópica, luz polarizada, contraste de interferencia (Nomarski), iluminación oblicua, así como epi-iluminación de campo claro y de fluorescencia para muestras opacas. Adquisición e interpretación con sistema de análisis de imágen. Software dotado de herramientas de Inteligencia Artificial.

El servicio de espectroscopía ofrece prestaciones para espectroscopía fotoelectrónica de Rayos X, espectroscopía infrarroja con transformada de Fourier, espectroscopía visible ultravioleta, espectroscopía Raman, difracción de Rayos X y análisis petrográfico

Permite a los distintos grupos de investigación del IATA, así como de otros centros y empresas, la observación microscópica y la microfotografía digital de distintos tipos de muestras, utilizando diferentes técnicas de microscopía óptica como: campo claro, luz polarizada, contraste de fases, contraste interdiferencial o Nomarsky, y fluorescencia. Para la microscopía de fluorescencia, pueden utilizarse 3 bloques de filtros diferentes para visualizar simultáneamente sobre la misma muestra distintos fluoróforos: DAPI,FITC, TRITC. Ejemplos de muestras con las que habitualmente trabajamos: Fibras y películas de distintos materiales (poliméricos, orgánicos,…) Salsas y masas panarias Rebanadas de pan Microorganismos: bacterias, levaduras y hongos filamentosos Células animales y humanas en cultivo Cortes histológicos Organismos pluricelulares modelo: C. elegans, A. thaliana

La unidad de microscopía e histología es un servicio de investigación que ofrece la posibilidad de preparar muestras y observarlas por microscopía óptica y confocal. La unidad provee acceso al siguiente equipamiento: Estación automática de deshidratación e inclusión de muestras en parafina, dos criostatos, un vibratomo, un micrótomo, cuatro microscopios de luz transmitida y epifluorescencia, dos de ellos invertidos y todos con microfotografía digital, un microscopio estereológico, un microscopio confocal, y un microscopio spinning disk. También se dispone de una workstation de última generación con diferentes softwares de análisis de imágenes: ImageJ/Fiji, Cell Profiler, LAS X y ZEN Blue. La unidad de histología y microscopia proporciona asistencia técnica desde el diseño de experimentos hasta el análisis de los resultados obtenidos. Su función es proveer un servicio de calidad en técnicas histológicas y microscopia óptica.

La microscopía óptica es una de las herramientas de investigación fundamentales en el IBFG. Hoy en día, con el desarrollo y las aplicaciones de las proteínas fluorescentes, es posible el diseño de experimentos complejos que permiten estudiar la dinámica de los procesos celulares en células vivas. Estos experimentos pueden ser realizados adquiriendo imágenes de las muestras que proporcionan información multidimensional en x, y, z, longitud de onda y tiempo. El servicio de microscopía tiene una dotación de equipos que permiten trabajar con una amplia gama de técnicas de microscopía óptica, desde la adquisición de imágenes de campo claro y fluorescencia convencional, hasta las microscopías confocales espectral y “spinning disk”. El servicio también tiene el equipamiento informático con los programas necesarios para el procesamiento de las imágenes adquiridas en los experimentos.

La presencia de marcadores fluorescentes en las muestras permite la utilización de una amplia variedad de aproximaciones experimentales en células vivas y fijadas. El servicio proporciona el equipamiento necesario para la realización de estudios de microscopía de epifluorescencia, confocal y superresolución mediante FLIM, FCS, DLS, STED, TIRF y SMLM, así como las herramientas informáticas para el procesamiento y análisis de las imágenes digitales generadas. El personal del servicio ofrece asistencia y entrenamiento en la utilización de los equipos, diseños experimentales, aplicaciones y metodologías de procesamiento/análisis de imagen. El servicio mantiene y proporciona un stock de reactivos, anticuerpos secundarios y soportes de cultivo ampliamente utilizados en las aplicaciones de microscopía de fluorescencia. El Servicio está certificado por la norma ISO 9001:2015, y forma parte de la Red de Laboratorios de la Comunidad de Madrid y la Red Española de Microscopía Óptica Avanzada.