Identificación genética, paternidad, trazabilidad y genotipificación

El servicio del Laboratorio de Genética del IREC (LGI) lleva a cabo investigación, docencia y formación en ecología, evolución, conservación y gestión de especies animales empleando técnicas moleculares. El servicio ofrece instalaciones, equipamiento, recursos analíticos y asesoramiento científico y técnico. Las técnicas sobre las que se ofrece servicio incluyen: Extracción de ADN y ARN Purificación de ADN y ARN Cuantificación de ADN y ARN Visualización de ADN Amplificación por PCR Lecture y alineamiento de secuencias Análisis de genética de poblaciones Análisis de filogenética y filogenómica Análisis de ADN ambiental (eDNA) Identificación molecular de especies Identificación de individuos Determinación del sexo Determinación de relaciones de parentesco Barcoding Metabarcoding Metagenómica Transcriptómica Elaboración de informes o peritajes Asesoramiento técnicas de análisis

El servicio de genómica funcional en peces del IIM tiene como objetivo facilitar la investigación en modelos animales de vertebrados acuáticos ofreciendo asesoramiento en diversas técnicas de biología molecular, genética y histología usando el pez cebra como especie modelo. El servicio oferta el procesado y análisis de las muestras, así como sus instalaciones y equipamiento, para que los propios clientes procesen y analicen sus muestras (autoservicio), siempre bajo el estricto cumplimento de las normas de uso del servicio. El servicio de genómica funcional en peces del IIM-CSIC (GFP-IIM-CSIC) ofrece soporte técnico a los usuarios en diversas técnicas de biología molecular, genética y histología usando el pez cebra como especie modelo. Las tareas que desempeña el servicio son las siguientes: • Micro-inyección de DNA, morpholino o mRNA en embriones de pez cebra. • Generación de líneas estables de peces cebra transgénicos y mutantes • Ensayos para screening de compue

El servicio utiliza técnicas moleculares básicas de trabajo con ácidos nucleicos para identificar especies animales o genes nucleares o mitocondriales. Básicamente se extrae ADN por medio de diferentes protocolos, específicos para cada tipo de tejido o taxon y las secuencias se amplifican por PCR con cebadores ya publicados o de nuevo diseño, se visualizan y purifican. La secuenciación o análisis de fragmentos se realizan en servicios externos al MNCN pero se ensamblan, se interpretan los resultados y se emite un informe del análisis. En numerosas especies la identificación se realiza por barcoding (COI). La determinación molecular del sexo, el análisis poblacional o de paternidad se realiza después de un estudio previo sobre conocimiento publicado de cada especie. Las muestras de tejido, pequeños especímenes o partes de ellos y ADN pueden ser preparado para su preservación en seco a temperatura ambiente y/o transporte por medio de liofilización.

Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de ecología molecular: identificar el sexo de los individuos, identificar individuos de poblaciones salvajes mediante sus heces, determinar relaciones de parentesco entre individuos, detectar cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilizar marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos. Los marcadores nucleares se pueden desarrollar, optimizar y tipar para conocer mejor las relaciones entre individuos, poblaciones y especies. Se ofrece asimismo la posibilidad de secuenciar tanto genes diana mediante secuenciación Sanger como secuenciación de nueva generación de genomas enteros para estudios de genética poblacional, genética funcional y filogenias. las técnicas basadas en ARN están actualmente en expansión