Determinación molecular del sexo

El servicio del Laboratorio de Genética del IREC (LGI) lleva a cabo investigación, docencia y formación en ecología, evolución, conservación y gestión de especies animales empleando técnicas moleculares. El servicio ofrece instalaciones, equipamiento, recursos analíticos y asesoramiento científico y técnico. Las técnicas sobre las que se ofrece servicio incluyen: Extracción de ADN y ARN Purificación de ADN y ARN Cuantificación de ADN y ARN Visualización de ADN Amplificación por PCR Lecture y alineamiento de secuencias Análisis de genética de poblaciones Análisis de filogenética y filogenómica Análisis de ADN ambiental (eDNA) Identificación molecular de especies Identificación de individuos Determinación del sexo Determinación de relaciones de parentesco Barcoding Metabarcoding Metagenómica Transcriptómica Elaboración de informes o peritajes Asesoramiento técnicas de análisis

Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de ecología molecular: identificar el sexo de los individuos, identificar individuos de poblaciones salvajes mediante sus heces, determinar relaciones de parentesco entre individuos, detectar cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilizar marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos. Los marcadores nucleares se pueden desarrollar, optimizar y tipar para conocer mejor las relaciones entre individuos, poblaciones y especies. Se ofrece asimismo la posibilidad de secuenciar tanto genes diana mediante secuenciación Sanger como secuenciación de nueva generación de genomas enteros para estudios de genética poblacional, genética funcional y filogenias. las técnicas basadas en ARN están actualmente en expansión

El servicio emplea técnicas moleculares para abordar fundamentalmente el estudio de procesos evolutivos, centrados en la Sistemática (taxonomía y filogenia) y el análisis de variación genética para determinar la estructura poblacional, en la mayoría de los casos, con fines de conservación y gestión de especies. De esta forma, el laboratorio está preparado para conservar las muestras de estudio, extraer ácidos nucleicos (ADN y ARN) y proteínas, amplificar por PCR y clonación, analizar geles, preparar las muestras para su secuenciación, o analizar a tiempo real la amplificación de distintos marcadores moleculares. Aunque el laboratorio ha sido concebido para ser un servicio de usuarios, sus técnicos están preparados para dar formación, orientación y colaborar en el desarrollo de distintos estudios. De esta forma, visitantes de otros centros, apoyados por el personal del MNCN, tienen acceso al uso de este laboratorio.

El servicio ofrece apoyo a la investigación y asesoramiento en el empleo de técnicas moleculares para abordar cuestiones evolutivas, biogeográficas, ecológicas y de conservación y gestión de la biodiversidad. El servicio está preparado para la conservación de muestras de estudio (invasivas y no invasivas), extracción de ADN/ARN, puesta a punto y optimización de marcadores, amplificación por PCR, realización de electroforesis y análisis de geles, y preparación de muestras para su posterior secuenciación/genotipado. Igualmente, se ofrece servicio de análisis bioinformáticos a partir de los resultados obtenidos, así como asesoramiento y colaboración a la hora de interpretar los resultados. El servicio está concebido para colaborar activamente en el desarrollo de distintos estudios relacionados con la ecología molecular.

El servicio utiliza técnicas moleculares básicas de trabajo con ácidos nucleicos para identificar especies animales o genes nucleares o mitocondriales. Básicamente se extrae ADN por medio de diferentes protocolos, específicos para cada tipo de tejido o taxon y las secuencias se amplifican por PCR con cebadores ya publicados o de nuevo diseño, se visualizan y purifican. La secuenciación o análisis de fragmentos se realizan en servicios externos al MNCN pero se ensamblan, se interpretan los resultados y se emite un informe del análisis. En numerosas especies la identificación se realiza por barcoding (COI). La determinación molecular del sexo, el análisis poblacional o de paternidad se realiza después de un estudio previo sobre conocimiento publicado de cada especie. Las muestras de tejido, pequeños especímenes o partes de ellos y ADN pueden ser preparado para su preservación en seco a temperatura ambiente y/o transporte por medio de liofilización.