Protein Identification by LC/MS/MS (>50 proteins)

Laboratorio de Análisis Proteómico provisto de la tecnología necesaria para el análisis cualitativo y cuantitativo de proteomas a gran escala así como para la identificación y cuantificación de péptidos y proteínas diana. El laboratorio ocupa un espacio de 90 m2 en el que se disponen 4 espectrómetros de masas (4800 MALDI-TOF/TOF, Quantum Triple Quadrupole , LTQ Velos Linear ion trap y Orbitrap XL), diversos sistemas acoplados para cromatografía líquida convencional y nanocapilar (2xAgilet 1200, 2X Agilent 1100) y un sistema de IEF preparativo (IEF off-gel). Dispone asimismo de un robot para digestión automática (DigestPro MS, Intavis) y de los sistemas necesarios para la realización de geles 2D de tamaño pequeño y grande (2 x IPGphor y 2 x Ettan Dalt VI (GE), Protean y MiniProtean (BioRad)) así como para la adquisición y análisis de las imágenes (Scanner y SameSpots software). Dispone asimismo de aparataje propio necesario para el trabajo diario (centrífugas, arcones, etc).

PROTEÓMICA El equipamiento actual del Servicio es el siguiente: 2 unidades de isoelectroenfoque Protean IEF cell (BIO-RAD), para la primera dimensión de los geles 2D en tiras de 7 cm de diferentes rangos de pH: 3-10 no lineal, 3-10-lineal y 4-7 lineal. 1 Cubeta multigel Miniprotean Dodecacell (BIO_RAD), para la electroforesis simultánea de hasta 12 geles de 8 x 7 cm. Espectrómetro de masas MALDI-TOF-TOF Autoflex III (Bruker).. Espectrómetro de masas Q-Exactive (Thermo Scientific) dotado de una fuente de ionización nano conectada en línea a un nano-UPLC Easy-LC 1000.

El objetivo principal del Servicio de Análisis de Proteínas del IBVF es la identificación de proteínas de interés biológico, mediante espectrometría de masas. Para ello, cuenta con diferentes equipos para la preparación y el análisis de las muestras: -Sistema para el recorte automatizado de proteínas en gel de una o dos dimensiones, Modelo EXQuest Biorad. -Espectrómetro de masas híbrido, Triple cuadrupolo-TOF acoplado a nanoLC, Modelo 5600, Sciex, que permite análisis LC-MS/MS.