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Instituto
INSTITUTO BIOFISIKA

Investigador principal
DANIEL CASTAÑO DIEZ

Métodos numéricos de tomografía crioelectrónica.


El grupo de Castaño se dedica al avance de los métodos numéricos para la tomografía crioelectrónica, incluidos todos los aspectos de la fuente de información: alineación, reconstrucción, ubicación de partículas, promediado de subtomogramas y clasificación.
Esto incluye explorar protocolos para el uso cooperativo de otras técnicas de imágenes de la biología estructural y celular (como microscopía de luz de superresolución) hacia la integración de información en múltiples escalas en el espacio y el tiempo, con el objetivo de completar estudios mecanicistas de procesos vitales clave.
El grupo está comprometido con la producción de software robusto y fácil de usar, integrando los avances más recientes de las matemáticas numéricas (desde la optimización heurística hasta el aprendizaje profundo) como algoritmos diseñados específicamente para la tomografía crioelectrónica y diseñados para un uso óptimo de la computación de alto rendimiento. recursos como GPU o clústeres a gran escala.

Especialización principal
Área de investigación:
Disciplina ERC:
  • LS - LIFE SCIENCES
  • LS1 Molecular and Structural Biology and Biochemistry
Industrial Leadership:
  • 4. Biotechnology
  • 4.3. Innovative and competitive platform technologies
Societal Challenges:
  • 1. Health, demographic change and wellbeing
  • 1.11. Improving scientific tools and methods to support policy making and regulatory needs