Desarrollo de software científico

El Servicio de Análisis por Técnicas No destructivas del MNCN-CSIC de Madrid presta su asistencia a aquellos departamentos y/o grupos de Investigación del MNCN así como a otros organismos o entidades públicas o privadas, que así lo soliciten. El Servicio cuenta con un Microscopio Electrónico de Barrido Ambiental (QUANTA 200, con opción de Alto y Bajo Vacío y modo Ambiental) con EDS y WDS y Peltier de enfriamiento y calentamiento; un Microscopio Electrónico de Barrido de Bajo y Alto Vacío (Inspect) con EDS y Catodoluminiscencia espectral y de imagen en UV-IR; Microscopio Confocal con espectroscopia RAMAN con pletina de enfriamiento, un Microscopio Confocal Espectral de fluorescencia, Tomografía Computerizada de Rayos X (CT-scan), un Microscopio 3D de alta resolución y equipos de apoyo como el de de análisis térmico ATD/ TGA (Perkin Elmer) y un analizador de la distribución del tamaño de partícula por difracción láser (Beckman- Coulter), Secado por punto Crítico y metelizadores de Au

El catálogo de servicios que ofrecemos incluye: [1] Consultoría y desarrollo de software para el análisis y anotación de resultados de experimentos de secuenciación masiva. Tenemos experiencia en estudios de genotipado y secuenciación pangenómica y análisis RNAseq y ChIPseq en bacterias y plantas. [2] Análisis de secuencias reguladoras en genomas de plantas. [3] Análisis computacional de la estructura de proteínas y mutagénesis dirigida. El servicio de bioinformática dispone de varios servidores de cálculo Linux dedicados a la investigación, incluyendo máquinas multicore con hasta 256GB de RAM y un equipo con una GPU con 10496 CUDA cores. De estos equipos planeamos dedicar un máximo de un 20% de su capacidad para el servicio. El usuario puede proporcionarnos un disco duro para guardar su datos o alternativamente almacenarlos en la nube de manera temporal. Los usuarios interesados en estos servicios deben contactar con los responsables por medio del correo electrónico:

La unidad de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina Lopez-Neyra se dedica a dar soporte a los investigadores en sus análisis, así como la colaboración en los análisis de datos a gran escala. Construcción y mantenimiento de una infraestructura computacional que permite a los investigadores implementar soluciones eficaces a la hora de analizar, visualizar o interpretar datos, principalmente genómicos. Formación y fomento de conocimiento a través de cursos y seminarios para los usuarios. Servicios disponibles: 1.Técnicas de Análisis de expresión (RNA-Seq o microarrays) 2.Técnicas de Análisis de asociacion de Genoma (GWAS) 3.Análisis funcionales

Idiomas: EN, ES, FR. Bioinformática: análisis de datos procedentes de secuenciación masiva (NGS), metagenómica, análisis, anotación y ensamblaje de genomas, filogenia, etc. Biocomputación: Modelado y simulación de macromoléculas, e interacciones moleculares, dinámica molecular, docking, análisis de afinidad por drogas, modelos de química cuántica. Computación Científica: modelos matemáticos, estadísticos y epidemiológicos complejos. Desarrollo y programación científica: (+20 lenguajes, web, paralela y distribuída) Formación: Realización de cursos de ámbito internacional en los temas de experiencia del servicio, tales como: Bioestatistics, Phylogeny, Metagenomics, Programming, Molecular Modeling. Coordinación: coordinación con otros servicios, instituciones y grupos de investigación a nivel internacional. Equipamiento: Equipo de cómputo dedicado, acceso a los clusters del CNB, del CSIC y del CESGA. Servidor web: sci.cnb.csic.es free-bit.org