Estudios de DNA y RNA

El servicio del Laboratorio de Genética del IREC (LGI) lleva a cabo investigación, docencia y formación en ecología, evolución, conservación y gestión de especies animales empleando técnicas moleculares. El servicio ofrece instalaciones, equipamiento, recursos analíticos y asesoramiento científico y técnico. Las técnicas sobre las que se ofrece servicio incluyen: Extracción de ADN y ARN Purificación de ADN y ARN Cuantificación de ADN y ARN Visualización de ADN Amplificación por PCR Lecture y alineamiento de secuencias Análisis de genética de poblaciones Análisis de filogenética y filogenómica Análisis de ADN ambiental (eDNA) Identificación molecular de especies Identificación de individuos Determinación del sexo Determinación de relaciones de parentesco Barcoding Metabarcoding Metagenómica Transcriptómica Elaboración de informes o peritajes Asesoramiento técnicas de análisis

Se ofrecen análisis de metabolitos y material genético en muestras vegetales. Se dispone de instrumentación, programas informáticos, bases de datos, protocolos, información, experiencia y conocimientos técnicos. La plataforma metabolómica, consistente en un UHPLC-MS Q-TOF y paquetes bioinformáticos, fue instalada en junio del 2021. La sección de genómica esta especializada en la aplicación y desarrollo de herramientas moleculares útiles para la mejora genética de cebada, especies frutales y vid. Las prestaciones disponibles son: - Análisis metabolómico mediante LC-Q/TOF MS - Análisis bioinformático de los resultados de metabolómica - Análisis HPLC-MS - Análisis de compuestos por UHPLC-MS-MS-Q-TOF - Estudios de DNA y RNA - Estudios de expresión génica: microchips de DNA y RT-PCR, ddPCR - Genotipificación, SNP, CNV - Asesoramiento de biología molecular en proyectos de mejora vegetal - Identificación molecular de especies - Identificación molecular de poblaciones

El servicio de genómica funcional en peces del IIM tiene como objetivo facilitar la investigación en modelos animales de vertebrados acuáticos ofreciendo asesoramiento en diversas técnicas de biología molecular, genética y histología usando el pez cebra como especie modelo. El servicio oferta el procesado y análisis de las muestras, así como sus instalaciones y equipamiento, para que los propios clientes procesen y analicen sus muestras (autoservicio), siempre bajo el estricto cumplimento de las normas de uso del servicio. El servicio de genómica funcional en peces del IIM-CSIC (GFP-IIM-CSIC) ofrece soporte técnico a los usuarios en diversas técnicas de biología molecular, genética y histología usando el pez cebra como especie modelo. Las tareas que desempeña el servicio son las siguientes: • Micro-inyección de DNA, morpholino o mRNA en embriones de pez cebra. • Generación de líneas estables de peces cebra transgénicos y mutantes • Ensayos para screening de compue

El servicio de Genómica Microbiana se puso en funcionamiento en mayo 2020 a raíz de la situación de la Pandemia COVID-19 con el fin de apoyar la iniciativa desarrollada por el Ministerio de Transición Ecológica y Reto Demográfico para establecer una vigilancia microbiológica en aguas residuales que se pueda utilizar como indicador epidemiológico para la detección de la circulación de microorganismos patógenos en la población. En un primer momento, la actividad se centró en la detección y cuantificación de SARS-CoV-2 en aguas residuales, así como de las nuevas variantes de preocupación que han ido surgiendo, pero actualmente abarca la detección y cuantificación de muchos otros patógenos humanos. Concretamente, el Servicio de Genómica Microbiana se centra en la detección de microrganismos patógenos de relevancia en Salud Pública. Estos análisis se complementan con la secuenciación de genomas completos para la caracterización y serotipado de microorganismos.

La Colección del MIcrobioma de Plantas surge con el objetivo de consolidar las colecciones de endófitos del IRNASA-CSIC. Durante las dos últimas décadas varios grupos de investigación del IRNASA-CSIC se ha dedicado al estudio de la diversidad biológica y función de microorganismos no patógenos asociados a plantas, principalmente hongos y bacterias endófitas, dando lugar a una extensa colección de microorganismos. Actualmente estamos trabajando en tareas de conservación, clasificación e identificación de los recursos existentes. Actualmente ofrece los siguientes servicios a usuarios internos y externos: - Análisis de calidad de DNA, RNA mediante un bioanalizador de fragmentos basado en electroforesis automático de alta resolución - Identificación de cultivos de hongos filamentosos basada en secuenciación de rDNA - Caracterización de cepas: capacidad de solubilización de fosfato