Desarrollo de aplicaciones de análisis y tratamiento de datos

Dig4Agro es un servicio del Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA) a disposición de investigadores y otros usuarios que ofrece la adquisición y análisis de información remota de cultivos y vegetación forestal para generar productos geomáticos de alta calidad (ej: mosaicos, nube de puntos, modelos digitales de superficie, mapas cartográficos), así como el desarrollo de algoritmos de procesamiento adaptados a los requerimientos del usuario. Dig4Agro cuenta con investigadores especializados, equipos de monitorización (dron, cámaras, sensores, equipo GPS-RTK) y software de análisis.

El servicio de Bioinformática apoya a los grupos de investigación del CBMSO realizando (a) análisis bioinformáticos, (b) aconsejando en los aspectos computacionales de los proyectos de investigación, (c) organizando cursos sobre herramientas informáticas bácicas y avanzadas y (d) gestionando el equipamiento informático de uso común, en particular los ordenadores implicados en el almacenamiento y análisis de los datos de secuenciación masiva que el CBMSO comparte con otros institutos.

En base a experiencia ganada en proyectos de investigación y contratos con empresas, el IFISC crea una unidad de servicios dedicada a la minería y al análisis de Big Data dando servicio a IFISC, CSIC y entidades externas. Esto comprende: colección y análisis de datos de Twitter, telefonía móvil, tarjetas de crédito, Flighradar24, redes de transporte urbano, censo, resultados electorales geolocalizados, electrocardiogramas, electro y magneto-encefalogramas, poblaciones de animales y corrientes marinas. Actualmente se recogen y analizan más de 40 GB/día de datos de sistemas socio-técnicos, biomédicos y medioambientales. Se han realizado estudios de población, de movilidad, transporte y turismo, uso del suelo, desigualdad económica en ciudades, propagación de retrasos en tráfico aéreo y epidemias en base a datos geolocalizados, análisis de arritmias cardiacas, encefalogramas, migraciones y conectividad espacial de fauna marina con datos satelitales.

El servicio de Espectrometría de Masas comprende 4 espectrometros de masas con diferentes analizadores y sistemas de ionización. La técnica permite la caracterización de sustancias a partir de su masa molecular y la masa de iones obtenidos por la fragmentación molecular. La espectrometría de masas puede ser utilizada tanto en análisis cualitativo como cuantitativo y su alta sensibilidad permite llegar a muy bajos límites de detección. Además, el acoplamiento con la cromatografía de líquidos (HPLC) permite el análisis de mezclas complejas. Este Servicio presta apoyo a la actividad investigadora del Centro así como a usuarios de otras instituciones externas.

El grupo de investigación tec4AGRO (www.csic.es/tec4AGRO) ofrece este Servicio a disposición de investigadores y otros usuarios interesados en la adquisición de información remota de cultivos y bosques a través de plataformas de teledetección, principalmente basadas en drones y diversos sensores (visible-RGB, multi-espectral). El Servicio también ofrece el procesamiento y análisis de los datos e imágenes obtenidos con algoritmos propios y/o de software comercial, lo que nos permite generar un producto final georreferenciado y de alta calidad adaptado a los requerimientos del usuario. Para ello, el Servicio cuenta con un equipo humano especializado y dispone de tecnologías de monitorización que incluyen drones, cámaras y sensores, equipo GPS-RTK, acceso a servidores de imágenes de satélite, y software específico para el análisis de imágenes y datos geo-espaciales.

La unidad de bioinformática del Instituto de Parasitología y Biomedicina Lopez-Neyra se dedica a dar soporte a los investigadores en sus análisis, así como la colaboración en los análisis de datos a gran escala. Construcción y mantenimiento de una infraestructura computacional que permite a los investigadores implementar soluciones eficaces a la hora de analizar, visualizar o interpretar datos, principalmente genómicos. Formación y fomento de conocimiento a través de cursos y seminarios para los usuarios. Servicios disponibles: 1.Técnicas de Análisis de expresión (RNA-Seq o microarrays) 2.Técnicas de Análisis de asociacion de Genoma (GWAS) 3.Análisis funcionales