El servicio de Bioinformática apoya a los grupos de investigación del CBMSO realizando (a) análisis bioinformáticos, (b) aconsejando en los aspectos computacionales de los proyectos de investigación, (c) organizando cursos sobre herramientas informáticas bácicas y avanzadas y (d) gestionando el equipamiento informático de uso común, en particular los ordenadores implicados en el almacenamiento y análisis de los datos de secuenciación masiva que el CBMSO comparte con otros institutos.
Bioinformática: Uso del cluster bioinformático
Descripción del servicio
Uso de los nodos de cálculo del servicio, del software y del sistema de almacenamiento de datos.
El Servicio de Bioinformática Marina (SBM) ofrece soluciones integradas para la gestión, almacenamiento y análisis de datos de secuenciación masiva de ADN de microorganismos marinos, aunque por su infraestructura y funcionamiento, puede también abrirse a otros organismos marinos (peces, cnidarios, etc). El núcleo del servicio es un cluster de computación IBM IDataPlex con 288 unidades de proceso y 1000 GB de RAM en 12 nodos de computación, escalable a 40 nodos, así como un servidor DELL PowerEdge T710 con 16 CPU y 16 GB de RAM y un servidor de backup Supermicro 6047R-E1R36N con 48 TB de almacenamiento. El SBM puede desde realizar análisis completos de datos de secuenciación, a la formación en biología computacional de sus usuarios, pasando por la gestión y desarrollo de software a medida.
Bioinformática: Uso del cluster bioinformático
Descripción del servicio
Uso de horas de CPU o de paquetes de 4 GB de RAM en el clúster bioinformático del servicio. Alta en el sistema de gestión de colas para poder enviar trabajos por lotes.
Almacenamiento de datos en sistema de ficheros Lustre y copia de seguridad en cinta.