Análisis de compuestos: UPLC-MS-MS-QTOF

Análisis cualitativo y cuantitativo de metabolitos secundarios en plantas (fundamentalmente en crucíferas, maíz) mediante técnicas cromatográficas de alta eficacia (HPLC y UPLC). Los análisis pueden incluir así mismo la extracción y purificación parcial de los metabolitos previas a la determinación cromatográfica. Cuantificación de pigmentos (clorofila, carotenoides y antocianinas) y de la capacidad antioxidante de extractos vegetales mediante técnicas espectrofotométricas.

El servicio de análisis y determinación estructural incluye diversas técnicas utilizadas para determinar la composición elemental y la estructura molecular de sustancias químicas puras o de mezclas de las mismas. Adicionalmente se podrán cuantificar las sustancias en mezclas simples o complejas. El servicio dispone de equipos de: 1.- Análisis elemental 2.- Infrarrojo 3.- UV-visible 4.- Polarímetro para determinación de actividad óptica 5.- Espectrometría de masas 6.- Espectroscopía de resonancia magnética nuclear 7.- UV-Con esfera integradora 8.- Servicio de cálculo científico 9.- Sistema de purificación de disolvente (SPS)

Análisis de compuestos orgánicos. Identificación basada en coincidencia con la masa exacta, con un error de 5ppm y semejanza de perfil isotópico. Si se solicita, determinación del parámetro “collision cross section (CCS)”, que es un valor robusto y preciso de las propiedades fisicoquímicas de un ion. Análisis de proteínas purificadas, hasta 50kD.

Se ofrecen análisis de metabolitos y material genético en muestras vegetales. Se dispone de instrumentación, programas informáticos, bases de datos, protocolos, información, experiencia y conocimientos técnicos. La plataforma metabolómica, consistente en un UHPLC-MS Q-TOF y paquetes bioinformáticos, fue instalada en junio del 2021. La sección de genómica esta especializada en la aplicación y desarrollo de herramientas moleculares útiles para la mejora genética de cebada, especies frutales y vid. Las prestaciones disponibles son: - Análisis metabolómico mediante LC-Q/TOF MS - Análisis bioinformático de los resultados de metabolómica - Análisis HPLC-MS - Análisis de compuestos por UHPLC-MS-MS-Q-TOF - Estudios de DNA y RNA - Estudios de expresión génica: microchips de DNA y RT-PCR, ddPCR - Genotipificación, SNP, CNV - Asesoramiento de biología molecular en proyectos de mejora vegetal - Identificación molecular de especies - Identificación molecular de poblaciones

La actividad principal del Servicio de Análisis Instrumental del ICVV consiste en proporcionar herramientas analíticas básicas para la selección, separación y análisis de metabolitos. Equipamiento actual: - Cromatógrafo Shimadzu Nexera-ABSciex 3200QTRAP, UHPLC-DAD-MS (tripleQ-trampa). - Cromatógrafo Waters Adquity I-Class- Detector DAD - Espectrometro de masas QToF Waters SYNAPT XS HDMS - Cromatógrafo Shimadzu Nexera UHPLC- DAD. - Cromatógrafo Shimadzu Prominence HPLC-FLUORESCENCIA-LIGHT SCATTERING. - GCMS - HPLC Preparativo Prestaciones generales: A Análisis cualitativo de analitos en mezclas complejas. B Análisis cuantitativo de analitos en mezclas complejas. C Análisis metabolomicos de mezclas complejas D Tratamiento de datos y preparación de informes E Utilización por el usuario. F Asesoramiento básico de la técnica. El Servicio no dispone de ninguna prestación acreditada, puesto que sus servicios están más orientados a la investigación

La Plataforma de Metabolómica pretende dar un servicio a todos los grupos de investigación interesados en estudios de metabolómica. La reciente adquisión de UPLC-QTOF 6550-I-Funnel junto con la reciente incorporación de la plataforma analítica "UPLC-UV-QToF-MS-SPE-RMN" nos permitirán conocer e identificar distintos tipos de metabolitos de bajo peso molecular en diferentes tipos de biofluidos o directamente en tejidos vegetales y animales.