- Grupo
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- TIC, Análisis Computacional y Matemático y Cartográfico
Administración de sistemas de computación científica
| Unidad de servicio | Información de la unidad de servicio | Prestación seleccionada | Otras prestaciones de servicio |
|---|---|---|---|
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LABORATORIO DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL CEAB - Blanes |
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ICM - Barcelona |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: LABORATORIO DE BIOLOGIA COMPUTACIONAL
- Instituto: CENTRO DE ESTUDIOS AVANZADOS DE BLANES
- Localidad: Blanes (Girona)
- Web del servicio: http://www.ceab.csic.es/
Actualmente la instalción del CBLab ocupa una sala climatizada que alberga un "cluster computer" con 284 cores de ejecución, 2,5 Terabytes de memoria RAM y 44 Terabytes de capacidad de almacenamiento en disco duro. El sistema operatio es el Biolinux8 (soportado en Ubuntu 12.04 LTS Server) Linux x64, y un administrador de la cola de espera del sistema "Sun Oracle GridEngine". El cluster puede albergar entre 70-100 usuarios registrados, las principales funcionalidades del cluster son el "code storage" (gitlab), análisis bioinformáticos, generación de modelos ecológicos y servicio de mapeado online de 5-10Gb Ethernet. Los lenguages que admite son R, Matlab, C/C++, Java, Python, SQL y PHP. Dos téccnicos están al cargo de todo el servicio informático, añadir/eliminar software, control y ayuda de los usuarios para paralelizar adecuadmente y/o optimizar los procesos y rutinas de computación. El cluster provee también servicio a científicos externos del CEAB mediante el pago de cuotas.
Administración de sistemas de computación científica
Descripción de la prestación
Utilización de clusters (hasta 500 cores) para computación, generación de modelos teóricos, diseño y apoyo al tratamiento de datos y generación de modelos aplicados.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| General | € / h | 16.22 € | 19.31 € |
Datos Generales del Servicio
- Unidad de servicio: BIOINFORMÁTICA MARINA
- Instituto: INSTITUTO DE CIENCIAS DEL MAR
- Localidad: Barcelona (Barcelona)
- Web del servicio: http://www.icm.csic.es/
El Servicio de Bioinformática Marina (SBM) ofrece soluciones integradas para la gestión, almacenamiento y análisis de datos de secuenciación masiva de ADN de microorganismos marinos, aunque por su infraestructura y funcionamiento, puede también abrirse a otros organismos marinos (peces, cnidarios, etc). El núcleo del servicio es un cluster de computación IBM IDataPlex con 288 unidades de proceso y 1000 GB de RAM en 12 nodos de computación, escalable a 40 nodos, así como un servidor DELL PowerEdge T710 con 16 CPU y 16 GB de RAM y un servidor de backup Supermicro 6047R-E1R36N con 48 TB de almacenamiento. El SBM puede desde realizar análisis completos de datos de secuenciación, a la formación en biología computacional de sus usuarios, pasando por la gestión y desarrollo de software a medida.
Administración de sistemas de computación científica
Descripción de la prestación
Gestión integral del cluster informático del servicio, incluyendo gestión de usuarios (altas, bajas) y grupos. Gestión de permisos, establecimiento de cuotas de almacenamiento, cálculo y memoria. Gestión de los volumenes de almacenamiento. Configuración y gestión del sistema de colas (SLURM). Auditoría (y en su caso facturación) de horas de procesador, memoria y almacenamiento. Monitorización del estado y la carga del sistema a través de Ganglia y Nagios. Instalación y mantenimiento del sistema operativo, software de terceras partes y librerías. Administración de sistemas (Rdiff-backup, rsync y bacula) para el respaldo de los datos de uso común (bases de datos, secuencias, etc) así como de los datos originales privados y los ficheros de resultados generados por los usuarios.| Opciones | Unidad | Sector Público | Otros Clientes |
|---|---|---|---|
| Administración de sistemas de computación científica | € / h | 143.57 € | 229.7 € |