Caracterización del metabolismo microbiano

Service description

CNBIO ofrece un servicio de: Consultoría y diseño integral de microorganismos, rutas metabólicas y prototipos mejorados para aplicaciones biotecnológicas. Los clientes pueden plantear un problema biológico y el equipo del nodo se compromete a estudiar el problema y ofrecer un dossier con posibles acciones de I + D + i. Estas soluciones podrán posteriormente implementarse en el servicio mediante un acuerdo específico siguiendo los modelos de contratación del CSIC. Design: En Design, CNBIO ofrece: D.1 Modelado metabólico a escala genómica de cepas individuales y de comunidades microbianas naturales y sintéticas. D.2 Análisis de sistemas y definición del espacio metabólico de cepas ambientales, industriales y de relevancia médica. D.3 Diseño y optimización de cepas con interés biotecnológico D.4 Modelado multi-cepa de aislados clínicos y comparativa funcional D.5 Modelado y diseño de comunidades microbianas ambientales, así como su estudio funcional e identificación de especies claves a partir de datos de metagenómica provenientes de secuenciación masiva (16S/18S/ITS/Metagenoma/Metatranscriptoma). D.6 Modelado y análisis de sistemas de microbiomas humanos para la inferencia de interacciones metabólicas así como la predicción de funcionalidades de los mismos. BUILT: En Built, CNBIO ofrece: B.1 Servicio de clonaje de fragmentos de DNA Este servicio ofrece el clonaje de fragmentos de DNA en plásmidos usando técnicas clásicas de biología molecular. Dicha metodología incluye el uso de enzimas de restricción. B. 1.1. Clonaje modalidad A. Fragmento a clonar proporcionado por el usuario. B. 1.2. Clonaje modalidad B. Fragmento a clonar de tamaño pequeño (menos de 1 kb) no proporcionado por el usuario. B. 1.3. Clonaje modalidad C. Fragmento a clonar de tamaño grande (~3 kb) no proporcionado por el usuario. B. 2 Servicio de ensamblaje de DNA por Gibson Este servicio ofrece el clonaje de fragmentos de DNA usando la técnica de ensamblado isotérmico (¿Gibson assembly¿). B. 3 Servicio de ensamblaje modular de DNA por MoClo. Este servicio ofrece el ensamblaje de unidades transcripcionales modular utilizando la tecnología de Golden Standard. B. 3.1. Ensamblaje modalidad A. Gen a ensamblar proporcionado por el usuario. B. 3.2. Ensamblaje modalidad B. Gen a ensamblar de tamaño pequeño (menos de 1 kb) no proporcionado por el usuario. B. 3.3. Ensamblaje modalidad C. Gen a ensamblar de tamaño grande (~3 kb) no proporcionado por el usuario. TEST: En Test, CNBIO ofrece la posiblidad de ejecutar protocolos robotizados de biología molecular e ingeniería evolutiva robotizada y de alto rendimiento. T. 1 Servicio de diseño de flujos de trabajo robotizados en Opentrons (OT-2) Este servicio ofrece el diseño personalizado de flujos de trabajo basados en manipulación de líquidos ejecutados mediante un pipeteador robotizado OT-2. T. 1.1. Diseño de protocolos OT-2. Conceptualización o modificación sobre script de Python de protocolos personalizados. T. 1.2. Validación experimental de protocolos OT-2. Ejecución de pruebas de operación a bordo de OT-2 y ajuste de protocolos. T. 2 Servicio de evolución adaptativa de laboratorio (ALE) Este servicio ofrece el diseño y ejecución de experimentos de evolución adaptativa en microorganismos modelo y no modelo no patógenos. T. 2.1. Implementación de un ciclo ALE manual T. 2.1. Implementación de un ciclo ALE robotizado T. 3 Servicio de diseño y fabricación de prototipos CAD 3D Este servicio ofrece el diseño y manufactura de piezas a medida. T3.3. Diseño CAD 3D T3.2. Manufactura CAD 3D