Ultrasecuenciación: Determinación de regiones enriquecidas en experimentos ChIP-seq

El Servicio de Bioinformática y Bioestadística está organizado en cuatro Áreas principales: - Análisis de datos de secuenciación de nueva generación (NGS). - Análisis de secuencias y predicción de estructura. - Análisis bioestadístico de datos. - Soporte a los usuarios en el acceso a los recursos de computación científica del CSIC.

El catálogo de servicios que ofrecemos incluye: [1] Consultoría y desarrollo de software para el análisis y anotación de resultados de experimentos de secuenciación masiva. Tenemos experiencia en estudios de genotipado y secuenciación pangenómica y análisis RNAseq y ChIPseq en bacterias y plantas. [2] Análisis de secuencias reguladoras en genomas de plantas. [3] Análisis computacional de la estructura de proteínas y mutagénesis dirigida. El servicio de bioinformática dispone de varios servidores de cálculo Linux dedicados a la investigación, incluyendo máquinas multicore con hasta 256GB de RAM y un equipo con una GPU con 10496 CUDA cores. De estos equipos planeamos dedicar un máximo de un 20% de su capacidad para el servicio. El usuario puede proporcionarnos un disco duro para guardar su datos o alternativamente almacenarlos en la nube de manera temporal. Los usuarios interesados en estos servicios deben contactar con los responsables por medio del correo electrónico: