Biología Molecular: Amplificación de material genético (PCR, qPCR)

El Laboratorio de Sistemática Molecular (LSM) del Real Jardín Botánico de Madrid (CSIC), se creó en 1997 con la finalidad de aplicar técnicas de biología molecular al estudio de la biodiversidad vegetal y fúngica desde tres disciplinas principales: 1.Sistemática (Taxonomía y Filogenia) 2.Biología Evolutiva 3.Ecología La incorporación de la biología molecular en los estudios sistemáticos, ha contribuido a ampliar la comprensión de la historia evolutiva (Biogeografía, Ecología Evolutiva, Biología de la Conservación). Desde su creación el LSM ha sido un apoyo fundamental clave en la producción científica, que incluye un gran número de artículos científicos en revistas de alto impacto. Las técnicas en biología molecular utilizadas en el laboratorio : • Extracción de ADN de plantas y hongos • Amplificación de ADN nuclear y citoplásmico mediante PCR • Purificación de productos amplificados • Clonación de genes • Técnicas fingerprinting RFLP, AFLP, etc

El grupo de inmunología y genómica tiene como objetivo incrementar el conocimiento sobre transcriptómica y proteómica de la respuesta inmune de peces y moluscos frente a patógenos. Además intentamos identificar genes que se puedan emplear como marcadores en procesos de selección genética y mejorar la respuesta inmune mediante el uso de inmunoestimulantes y vacunas. También prestamos apoyo a los investigadores en el análisis e interpretación de datos obtenidos mediante técnicas experimentales de secuenciación masiva.

Servicios analíticos para el diagnóstico de enfermedades de etiología parasitaria e infecciosa que afecten principalmente a rumiantes.

El Laboratorio de Biología Molecular (LBM) es un servicio de apoyo a la investigación que ofrece los siguientes servicios a usuarios internos y externos: • Realización de procesos de fermentación a media escala para la producción de proteínas recombinantes o de metabolitos de interés. • PCR a tiempo real • Soporte bioestadístico y bioinformático • Asesoramiento científico y técnico e impartición de seminarios. Para la realización de estas técnicas el LBM dispone de los siguientes equipos y software: • Planta de fermentación a media escala, compuesta de: • Fermentador Applikon BioBench de 30 litros. • Centrifuga semicontinua CEPA LE (30 litros/hora). • Homogeneizador Emulsiflex-C3 (prensa francesa, 3 litros/hora). • Equipo de PCR en tiempo real modelo7900HT de Applied Biosystems. • Software Bionumerics 6.6.4 • Equipo de captura de imágenes de geles y blots ChemiDoc MP System, asociado al software ImageLab software, y

Se ofrecen instalaciones, equipamiento, soporte técnico, formación y recursos analíticos al personal del centro. Estas infraestructuras y recursos humanos se usan en proyectos de investigación con diferentes objetivos que abarcan todo el espectro de ecología molecular: identificar el sexo de los individuos, identificar individuos de poblaciones salvajes mediante sus heces, determinar relaciones de parentesco entre individuos, detectar cambios demográficos a partir de marcadores neutrales o utilizar marcadores de genes bajo selección para entender procesos evolutivos. Los marcadores nucleares se pueden desarrollar, optimizar y tipar para conocer mejor las relaciones entre individuos, poblaciones y especies. Se ofrece asimismo la posibilidad de secuenciar tanto genes diana mediante secuenciación Sanger como secuenciación de nueva generación de genomas enteros para estudios de genética poblacional, genética funcional y filogenias. las técnicas basadas en ARN están actualmente en expansión

El Instituto de Investigaciones Marinas fué nombrado Laboratorio Nacional de Referencia de enfermedades de Moluscos Bivalvos según Real Decreto 1043/1997, de 27 de junio. Actualmente las funciones que debe desempeñar un Laboratorio Nacional de Referencia vienen establecidas en la Directiva europea vigente sobre los requisitos zoosanitarios de los animales y de los productos de la acuicultura y sobre la prevención y control de ciertas enfermedades de los animales acuáticos: a) Comprometerse a informar sin demora, al organismos competente cuando sospechen la aparición de cualquiera de las enfermedades listadas en la Directiva vigente b) Coordinar, previa consulta al Laboratorio Europeo de referencia, los métodos de diagnóstico empleados en los Estados miembros c) Contribuir activamente a la identificación de los focos de enfermedades, estudiando la materia aislada del agente patógeno enviada para confirmar diagnóstico y proceder a su caracterización y a los estudios epizoóticos

En el Servicio de Biología Molecular Marina se desarrolan diferentes técnicas de biología molecular basadas en el estudio de los ácidos nucléicos de organismos marinos. El servicio consta de quatro termocicladores, equipos de electroforesis, equipo qPCR (Cfx, Biorad), equipo para geles PFGE (CHEF DR-II, Biorad), equipo Gel Doc con software de análisis (iBright CL 1500, Invitrogen), fluorómetro (Qubit Q32857, Invitrogen), espectrofotómetro UV-Vis (NanoDrop One,Thermo Scientific) y analizador de biomoléculas (QSep100, Bio Optic) Además, consta de otros equipos necesarios como centrífugas, horno de hibridación, baño térmico, incubador térmico, desecador con bomba de vacío, campanas de flujo laminar, microondas, vórtex y placa agitadora/calefactora, entre otros, para el desarrollo de los diferentes protocolos.

El servicio de genómica funcional en peces del IIM tiene como objetivo facilitar la investigación en modelos animales de vertebrados acuáticos ofreciendo asesoramiento en diversas técnicas de biología molecular, genética y histología usando el pez cebra como especie modelo. El servicio oferta el procesado y análisis de las muestras, así como sus instalaciones y equipamiento, para que los propios clientes procesen y analicen sus muestras (autoservicio), siempre bajo el estricto cumplimento de las normas de uso del servicio. El servicio de genómica funcional en peces del IIM-CSIC (GFP-IIM-CSIC) ofrece soporte técnico a los usuarios en diversas técnicas de biología molecular, genética y histología usando el pez cebra como especie modelo. Las tareas que desempeña el servicio son las siguientes: • Micro-inyección de DNA, morpholino o mRNA en embriones de pez cebra. • Generación de líneas estables de peces cebra transgénicos y mutantes • Ensayos para screening de compue