Descripción del servicio
Entre sus prestaciones de análisis computacional de datos el Servicio ofrece:
-Selección de Métodos de Preprocesamiento y Análisis: Identificamos las herramientas y métodos de preprocesamiento y análisis de datos adecuados para el tipo de secuenciación.
-Planificación de Control de Calidad: Definimos estrategias para el control de calidad de los datos de secuenciación, como la eliminación de secuencias de baja calidad, la detección de artefactos y la evaluación de la cobertura.
-Análisis computacional de datos de secuenciación masiva (NGS): re-secuenciación (DNA-seq), ensamblaje de novo, RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, CLIP-seq, Exome-seq, Ribo-seq, IsoSeq, Single-cell, metabolómica, metagenómica 16S, 18S, ITS y de otro tipo de amplicones y shotgun. Análisis de enriquecimiento de rutas, búsqueda de variantes germinales o somáticas, SNP/InDel, CNV y variantes estructurales, microarrays, etc. Representación gráfica de los resultados de forma personalizada acorde a los requerimientos del usuario.
-Análisis computacional de datos de proteómica y metabolómica: Análisis estadístico de multivarianza de datos de proteómica y metabolómica, análisis de componentes principales (PCA) o de discriminación lineal (LDA) para agrupación de muestras dependiendo de la expresión de ciertas proteínas/metabolitos. Mapeo de proteínas/metabolitos en rutas metabólicas conocidas para analizar perfiles diferenciales. Representación gráfica de los resultados de forma personalizada acorde a los requerimientos del usuario.
-Análisis de integración de datos multiómicos: Combinación de datos ómicos de NGS como de genómica, transcriptómica, etc junto a los de metabolómica y proteómica para compresión completa de procesos biológicos. Análisis de aprendizaje automático para construir modelos predictivos. Representación gráfica de los resultados de forma personalizada acorde a los requerimientos del usuario.
-Desarrollo, implementación y creación de software personalizado para el análisis de datos: Programación en diferentes lenguajes de acuerdo a las necesidades del Servicio (Phyton, R, Bash, Tcsh, etc.) para desarrollar scripts ad hoc.
-Análisis estadístico de datos experimentales: análisis exploratorio, test de hipótesis con métodos paramétricos y no paramétricos, métodos de estadística robusta, ANOVA, análisis de componentes principales (PCA), minería de datos (machine learning), curvas ROC, etc. Representación gráfica de los resultados de forma personalizada acorde a los requerimientos del usuario.
-Envío de secuencias a repositorios europeos, concretamente al European Nucleotide Archive (ENA) y European Genome-phenome Archive (EGA) perteneciente al European Bioinformatics Institute (EBI). Es una forma segura y confidencial de mantener los datos, además de ser requisito indispensable a la hora de publicar los resultados en revistas científicas. Como usuarios colaboradores de ENA (Brokers), nos encargamos del mantenimiento de los datos, así como de renovar la privacidad de los mismos.
Cuadro de opciones y precios
Opciones |
Unidad |
Sector Público |
Otros Clientes |
Dsllo, implem y creación de software personalizado |
hora |
21.63 € |
31.98 € |
Análisis de integración de datos multiómicos |
hora |
21.63 € |
31.98 € |
Análisis computacional de datos proteómica y metabolómica |
hora |
21.63 € |
31.98 € |
Análisis estadístico de datos experimentales |
hora |
21.63 € |
31.98 € |
Análisis computacional de datos secuenciación masiva (NGS) |
hora |
21.63 € |
31.98 € |