PIF2024-EXPANDIENDO LA CARACTERIZACION DE NUEVAS FUNCIONES DE LA AUTOFAGIA NO CONVENCIONAL Y SU RELEVANCIA EN LA PREVENCION DE LA ENFERMEDAD (PID2023-148747OB-I00)

La autofagia es un proceso degradativo que mantiene la homeostasis celular. Ratones deficientes en proteínas de la maquinaria autofágica (ATGs) muestran fenotipos patológicos como la neurodegeneración, patologías inflamatorias o cáncer, mostrando que la autofagia previene diversas enfermedades. Sin embargo, recientemente se ha visto que las ATGs presentan funciones adicionales no canónicas que son diferentes de la autofagia degradativa clásica. Trabajo realizado en nuestro grupo indica que son estas actividades atípicas (pero no la autofagia canónica) las se ven alteradas por un polimorfismo genético del efector autofágico ATG16L1 (T300A) cuya presencia incrementa el riesgo de sufrir enfermedades inflamatorias y cáncer, indicando que son precisamente las actividades no canónicas las que protegen de la patología. Por tanto, la identificación de estas funciones atípicas es importante para entender cómo ATG16L1 previene la enfermedad. El proyecto de Tesis Doctoral propone abordar esta cuestión en el caso particular del cáncer, caracterizando el papel no convencional que ATG16L1 tiene en la regulación de la muerte celular inmunogénica, en la biología tumoral y en la respuesta del cáncer a la quimioterapia. Para ello, se utilizará un amplio rango de técnicas de biología molecular y celular, biología de proteínas, cultivos celulares y manejo de ratones, incluyendo la manipulación genética por CRISPR/Cas9, microscopía confocal avanzada o modelos de tumorogénesis en ratón.