Se realiza el análisis cromatográfico de estándares de proteínas con los que se podrá hacer una curva de calibración que se utilizará para extrapolar la masa molecular de las proteínas de interés para el usuario .
El usuario deberá aportar los solventes a utilizar que deberán ser los mismos que se utilizan para la cromatografía analítica o semipreparativa.